在做手术的时候消毒是必须要做到位的，因为很多的情况下正是因为没有消毒做到位，所以在手术后造成的伤口感染，甚至是里面器官的感染都是会导致效果上出现问题的主要因素，其实手术是常用的灭菌方法，比如可以焚烧烧灼和干烤等等，其中包括了不同的技巧和方案。
比较常用的有五种
(一)热力灭菌法
热力能破坏微生物的蛋白质和核酸，使蛋白质变性凝固，核酸解链崩裂，从而导致其死亡。
1.干热灭菌法常用焚烧、烧灼和干烤等方法。
(1)焚烧与烧灼焚烧仅用于废弃的被病原微生物污染的物品、垃圾、人及动物尸体等。烧灼用于微生物实验室的接种环、金属器械、试管口、瓶口等的灭菌。
(2)干烤使用干烤箱灭菌，一般需加热至160℃～170℃经2h，可达到灭菌的目的。适用于玻璃器皿、瓷器、金属物品等的灭菌。
2.湿热消毒灭菌法
(1)巴氏消毒法法国学者巴斯德创用而得名。主要以较低温度杀灭病原菌或特定微生物，而使物品中不耐热成分不被破坏。此法有两种：一种方法是加热61.1℃～62.8℃、30min；另一种方法是加热71.7℃、15～30s。现在人们多用后种方法对牛奶进行消毒。
(2)煮沸法煮沸100℃、5～10min，可杀死细菌繁殖体。芽胞则需要煮沸1～2h。常用于注射器、食具与饮水的消毒。
(3)流通蒸气法用阿诺(Arnold)蒸锅或普通蒸笼，加热100℃、15～30min，可杀灭细菌的繁殖体。若将消毒后的物品放入37℃孵箱培养，使芽胞发育成繁殖体，次日再蒸一次，如此连续三次以上，可达到灭菌效果，这种方法称为间歇灭菌法。常用于不耐高温的物品，如糖类、血清和鸡蛋培养基等的灭菌。
(4)高压蒸气灭菌法是一种迅速而有效的灭菌方法。使用高压蒸气灭菌器，利用加热产生蒸气，随着蒸气压力不断增加，温度随之升高，通常压力在103.4kPa(相当旧制的15磅/吋2或1.05kg/cm2)时，器内温度可达121.3℃，维持15～30min，可杀灭包括芽胞在内的所有微生物。此法常用于一般培养基、生理盐水、手术器械及敷料等耐湿和耐高温物品的灭菌。