主要原因：明政府施行了严厉的“海禁”，限制泉州港只通琉球，使泉州港对外贸易受到极大限制；成化十年（1474年）市舶司移设福州，泉州的来远驿也随同市舶司废置，标志着泉州港四百年的外贸港地位的终结；清代清初战争和海禁、迁界的影响。泉州是中世纪著名的世界贸易港。但自明清始，泉州便逐步没落，昔日频繁兴盛的海港面貌不再复见。泉州港为何会由盛转衰呢？ 1.排外风潮，元朝末年，泉州发生叛乱，当地的色目人互相攻杀，波及福建省的大部分地区。直至至正二十六年，这埸色目武装集团的叛乱才被平定。这场战乱，使泉州的社会经济更遭受到严重破坏。泉州港跟亚非国家的贸易活动亦无法进行。战乱中，本土居民对地位日高的外来者十分不满，故此又发生了排外风潮，许多外国商贾纷纷航海离去。这埸战乱使泉州海外交通遭到严重破坏，它直接导致泉州港的衰落。2. 市舶司南迁。泉州市舶司迁移亦跟泉州港的衰落有着密切关系。宋元时期，统治阶级重视海外贸易，泉州市舶司员的认真执行对外开放政策，积极招徕外商来华通商，加强对出入港船舶和外商的管理。因此，市舶司促进了泉州港的发展，使它成为全国最大的贸易港继而成为世界最大的贸易港之一。明代时市舶司隶于布政司。福建布政司设于福州，主管市舶司的官员常往福州，由于琉球贡使到福州比泉州更为方便。又因为琉球办理朝贡和贸易的多数是福州人，乘朝贡之机，回乡探亲访友。所以到了明成化八年，福建市舶司从泉州迁往福州，市舶司的设立，见证了泉州港的繁荣昌盛，而它的迁移则标志着泉州港的衰落。 3.倭寇为患。明代初年，由于东南沿海倭寇、海盗为患，明太祖一方面为维持治安，一方面想改变元代的重商政策、恢复为传统的重农政策，实施了海禁。至清初，清政府从经济上封销郑成功，下令「迁界」，强迫沿海居民内迁，规定「片板不许下水，粒米不许越疆。」明朝海禁，泉州港衰落。整个明朝，泉州港的作用仅只体现在郑和下西洋朝贡性质的航海过程中提供专业人员和海船补给上，以及维系与琉球的部分朝贡。这时期，海禁使民间海外贸易被逼成走私，因为官府控制不力，加上地方商军官三者为了牟利形成一定的联合势力，使私商贸易有足够的生存空间成长土壤。尽管宋元的市舶官商制度已为民间私营商业所替代，但民间商业的海上开拓力量已大大下降。面对沿海商民依托地理优势进行频繁的走私活动，明朝政府试图通过掌握某些港口来控制化解其他走私港口的非法贸易，其中的漳州月港便在官府有限度的几次开禁张弛中兴起做大，成为东南沿海第一大私商大港。月港时代，大帆船不停往来于中国与菲律宾之间，贸易不断。西班牙从墨西哥运到菲律宾的白银经由中国海商源源不断地流向中国，而中国商品、移民则流向菲律宾，华商网络和华商社会开始形成。明清实行上述政策，破坏了泉州的社会经济和海外交通。所谓「靠山吃山，靠海吃海」，海上贸易是泉州人生活所依。可是，到明清时，这个国际性贸易大港却变成私商贸易港，可见海禁政策对泉州港产生的负面的影响。 到了十五世纪，欧洲的葡萄牙、西班牙、荷兰、意大利等国，先后发展成为殖民主义国家。他们的东侵，使东西海上贸易受到干扰，阻碍了泉州的海外交通发展，加上倭寇对泉州地区的骚扰及破坏，泉州港遂逐步走向衰落的道路。 鸦片战争后，中国海权丧失，沦为西方列强的半殖民地，沿海口岸被迫开放，成为西方倾销商品的市场，掠夺中国资源和垄断中国丝、瓷、茶等商品的出口贸易。从此，海上丝路一蹶不振，进入了衰落期。这种状况一直延续了整个民国时期，直至新中国成立前夕。4.地理的变迁。泉州港衰落的另一个不可忽视的原因就是地理的变迁。由于晋江流域植被的破坏，水土流失严重，大量泥沙流到下流出海口，不断淤积。泉州港是快沉积区，每年平均沉积度为四点六毫米，使泉州港失去作为优良港口的天然条件。