1号线续建（世界之窗站--深圳机场站）2004~2008年 罗湖站→国贸站→老街站→大剧院站→科学馆站→华强路站→岗厦站→会展中心站→购物公园站→香蜜湖站→车公庙站→竹子林站→桥城东站→华侨城站→世界之窗站（以上为一期站点）→白石洲站→科技园站→深大北站→南山医院站→前海路站→深圳西站→南头车辆段站→新安路站→宝安中心站→宝安体育中心站→西乡码头站→西乡中心站→固戌站→后瑞站→深圳机场站 1号线续建工程线路全长23.333km，其中：地下线18.14km，地面线0.415 km，高架线4.778km。新设13座地下站和2座高架站共15座车站。其中深圳西站为1号线与11号线换乘站，深圳机场站为1号线终点站。投资估算103.95亿元。计划2008年底建成。 2号线（蛇口西站--世界之窗）2004年底~2010年 蛇口西站→蛇口客运港站→海上世界站→南水路站→招商东路站→工业八路站→登良路站→南山商业中心站→科技园站→沙河东路站→世界之窗站 2号线工程全长14.35公里，除1.25公里地面线外，其余均为地下线。全线设11座，其中地下站10座，地面站1座。世界之窗站为1号线与2号线换乘站。沿线穿过蛇口老城区、规划填海发展区、高新技术园区和世界之窗旅游景区。投资估算55.9亿元。计划2010年建成。 3号线(红岭中路--龙兴街站) 2005~2009年 红岭中路站→老街站→东门中路站→人民医院站→田贝路站→布心站→布吉联检站→布吉客运站→布吉镇政府站→汇福花园站→丹竹头站→育马场站→塘坑站→新世界广场站→银海市场站→爱联学校站→吉祥路站→龙城广场站→龙兴街站 3号线工程全长32.913公里，其中：地下线6.92km，地面线0.28 km，高架线25.713km。设站19座，其中6座地下站和13座高架站。其中老街站为1号线与3号线换乘站。投资估算98.86亿元。计划2009年建成。 4号线续建（少年宫--龙华镇中心）2004~2008年 皇岗站→福民站→会展中心站→市民中心站→少年宫站（以上为一期站点）→莲花北站→梅林站→梅林检查站→白石龙站→龙华火车站→龙华中心站→上塘站→龙华镇中心站→龙华新城中心 4号线续建工程线路全长15.953km，其中：地下线4.551km，地面线1.15 km，高架线10.252km。设2座地下站，1座地面站和6座高架站，共9座车站。其中会展中心站为1号线与4号线换乘站。投资估算59.3亿元。计划2009年建成。 11号线（深圳西站--塘坑）2006~2010年 深圳西站→建工村站→西丽站→龙珠站→塘郎站→龙华站→板田站→雪岗站→上李郎站→平湖站→北通道站→塘坑站 1号线全长38.227km，设1座下沉式车站，3座高架站和8座地面站，共12座车站。11号线利用已有平南铁路改造。投资估算51.53亿元。计划2010年建成。